大便中粗渣长期停留、异物、某些炎性肠道疾病，如溃疡性结肠炎、克罗恩病等，可造成肠黏膜损伤，或长期刺激肠黏膜上皮，或细胞的产生增加，或肠黏膜上皮凋亡减慢，最终可形成肠息肉状突起。

幼年性息肉病多为错构瘤，可能与胚胎发育异常有关。

在结直肠恶变患者中，有10%的患者具有家族患恶变病史。同样，家族成员中有人患有腺瘤性息肉时，其他成员发生结直肠息肉的可能性明显升高，尤其是家族性息肉病具有明显的家族遗传性。另外，曾经患过其他部位恶变，如消化道恶变、乳腺恶变、子宫恶变以及膀胱恶变的患者结直肠息肉的发生率也明显升高。

高脂肪、高蛋白、低纤维素饮食、便秘、吸烟、酗酒、肥胖和缺乏运动等生活习惯可导致息肉发生率升高。

结肠息肉的发病率随着年龄的增大而增高。

2型糖尿病未得到良好控制的患者患病风险高。