目前，人们已经接受了结直肠癌并非是在结、直肠粘膜上突然发生的病变的观点，而是经历了“正常粘膜—>粘膜上皮增生—>腺瘤性息肉—>腺瘤性息肉逐渐增大—>结直肠癌”这样一个顺序发展的过程。这个过程大概需要5~10年，如果在这个过程中能够及时通过结肠镜发现并处理结直肠息肉，就可以阻止结直肠癌的发生。
结直肠癌起源于结直肠的粘膜层（最内层）的粘膜上皮细胞，随着疾病的进展，肿瘤细胞由里向外呈浸润性生长，通过粘膜下层、肌层，最后浸润至浆膜层。然后突破浆膜层，侵犯结直肠附近的器官。
另外，肿瘤细胞还可以通过淋巴管和血管转移至结直肠周围和远处器官。
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